Подскажите пожалуйста, насколько законны требования с одной стороны миграционной службы и с другой роддома?

Насчет роддома - загляните в Управление здравоохранения и/или обратитесь туда с письменным заявленим относительно требований роддома. Возможно, всё не совсем так.

Что касается получения "внутреннего паспорта", то его обязаны выдать в течение 10 дней.

Подать заявление жена вправе как в "пасортный стол ЖЭКа", так и лично - начальнику районного отделения ФМС РФ.

В случае отказа (даже устного) в приеме заявления - сразу обратитесь в прокуратуру. Начальника ФМС РФ "вылечат". Но перед "лечением" скажите куда пойдете. Иногда это уже здорово помогаем снять недомогание.

Да, если проблема не в паспорте, а именно в регистрации по месту жительства, решается так же, только заявление придется подавать "через паспортный стол". Алгоритм решения проблемы - тот же: прокуратура.

Нормативные акты:

Постановление Правительства РФ от 08.07.1997г. №828 в редакции от 20.12.2006 № 779 "Об утверждении Положения о паспорте гражданина РФ, образца бланка и описания паспорта гражданина РФ".

Приказ МВД РФ от 28 декабря 2006 г. № 1105 “Об утверждении Административного регламента Федеральной миграционной службы по предоставлению государственной услуги по выдаче, замене и по исполнению государственной функции по учету паспортов гражданина РФ, удостоверяющих личность гражданина РФ на территории РФ”.

Приказ Федеральной миграционной службы от 20.09.2007г. № 208 "Об утверждении Административного регламента предоставления Федеральной миграционной службой государственной услуги по регистрационному учету граждан Российской Федерации по месту пребывания и по месту жительства в пределах Российской Федерации".