Стоит ли идти на конфликт, отстаивая свои права в данной ситуации?

Статья определена правильно.

Согласно Приказу Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору

от 12 апреля 2005 г. N 138

"О перечне должностных лиц Россельхознадзора и территориальных управлений Россельхознадзора, уполномоченных составлять протоколы об административных правонарушениях"

(с изменениями от 16 апреля, 26 ноября 2007 г., 23 июня, 30 июля 2008 г., 6 мая 2009 г.), определёнными должностными лицами Россельхознадзора могут составляться такие протоколы.

Вот этот перечень:

1. В центральном аппарате Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору:

1.1. Руководитель Россельхознадзора, заместители Руководителя Россельхознадзора;

1.2. Начальники управлений и их заместители, начальники отделов в составе управлений и их заместители, и другие должностные лица Россельхознадзора, осуществляющие функции надзора и контроля, в пределах своей компетенции.

2. В территориальных управлениях Федеральной службы по ветеринарному и фитосанитарному надзору:

2.1. руководители территориальных управлений Россельхознадзора, заместители руководителей территориальных управлений Россельхознадзора;

2.2. начальники отделов территориальных управлений Россельхознадзора, заместители начальников отделов территориальных управлений Россельхознадзора и другие должностные лица территориальных управлений Россельхознадзора, осуществляющие функции надзора и контроля, в пределах своей компетенции.

У инспекторов может быть и было такое право, но для этого необходимо уточнять конкретно их компетенцию. Обычно это выясняется в суде, если при обжаловании Постановления о пивлечении к адм. ответственности, вы заявите, что инспектора действовали за пределами своей компетенции.

А вот привлекать к ответственности сами сотрудники Россельхознадзора не имели права. Они должны были передть материалы об административном правонарушении в Органы, осуществляющие государственный пожарный надзор или Органы, уполномоченные в области использования, охраны, защиты, воспроизводства лесов.

Кроме того, вы не пишите, приглашался ли нарушитель для рассмотрения его административного дела. Если нет, то это прямое нарушение КоАП РФ, данное обстотельство даже при доказанности и правомочности самого Протокола, послужит основание для отмены Постановления о пивлеч. к админ. отв-ти при обжаловании его всуде.