Как оформить равные доли при окончании реконструкции квартиры - через суд или при оформлении новых документов?

Хотелось бы получить консультацию по следующему вопросу: в 2004 году жена получила наследство 4/5 доли в квартире, а 1/5 осталась у родной сестры. Расположенной в 1-этожном 2-х квартирном доме. На тот момент мы (семья из 3 человек) имели комнату. Где было по 1/3 доли у каждого (я-муж, жена, и сын). В 2007 году оформляли 3-ную сделку (продажу комнаты, дарение 1/3 доли сыну от 4/5 в квартире, и покупка 1/5 доли у сестры). Фактически сестра сама подорвала комнату т.к. жила там с 2004 года. При оформлении этих сделок произошли ошибки в распределении долей. При составлении договора дарения (договор составлял сотрудник регпалаты, а мы просто подписывали) написали не 1/3 долю сына от 4/5 в квартире, а 2/3 доли от 4/5 в квартиры и документы оформили одним числом. А выкуп 1/5 у сестры оформили следующим днем. Но выдачу документов в регпалате произвели одним днем. И в итоге получилось что у сына стало 2/3 доли от всей квартиры (хотя должно быть 2/3 от 4/5 (получается 8/15) по договору, (а мы хотели 1/3 от 4/5)) а у жены получилось 1/3 от всей квартиры, хотя должно быть 1/3 от 4/5 (остаток от дарения) плюс 1/5 покупка у сестры (получается 7/15). Мы сразу в документы не вникли. Да и уже вели реконструкцию квартиры: строительство пристроя и возведения 2 этажа. Поэтому подумали при оформлении новых документов всё и пересмотрим. Но строительство протянулось (из-за финансов) до этого года. Да и семья теперь состоит из 5 человек (трое детей). При строительстве использовался маткапитал (в связи чем жена оформляла бумагу, что она обязана оформить квартиру в равных частях на всех членов семьи). Так вот у меня вопрос можем ли мы при оформлении документов в связи с окончанием реконструкции (и увеличением жилой площади) оформить равные доли (по 1/5 каждому), или нам необходимо вначале через суд исправить предыдущие ошибки? Как поступить правильнее?