Заведующая складом написала заявление об увольнении без передачи ТМЦ и организации инвентаризации - какие действия следует принять?

Ваши действия: оставить работу, если Вы реально хотите уволиться (ст. 80 ТК РФ: По истечении срока предупреждения об увольнении работник имеет право прекратить работу. В последний день работы работодатель обязан выдать работнику трудовую книжку, другие документы, связанные с работой, по письменному заявлению работника и произвести с ним окончательный расчет.Если по истечении срока предупреждения об увольнении трудовой договор не был расторгнут и работник не настаивает на увольнении, то действие трудового договора продолжается).

Все материальные претензии к Вам (при их наличии) работодатель будет решать в судебном порядке. Здесь существуют риски, что инвентаризация будет проведена без Вашего непосредственного участия и чего они там напишут в акте - кто знает...