Подскажите как грамотно это сделать, с чего начать?

Комната по площади должна соответствовать доле в квартире. Начать нужно с грамотного составления искового заявления, которое должно соответствовать требованиям статей 131-132 ГПК РФ.

Подайте мировому судье иск об определении порядка пользования жилым помещением. При этом указывайте не общую площадь квартиры, а жилую. Сложность будет в том, что комнаты смежные. Предложите сначала сособственникам провести перепланировку квартиры, в результате которой все комнаты станут изолированными. Если не согласятся, подайте иск об обязании провести перепланировку квартиры (не факт, что суд удовлетворит, но можно попытаться) и определить порядок пользования комнатами.

Да, можно в судебном порядке определить порядок пользования жилым помещением. Разрешая такое требование, суд учитывает фактически сложившийся порядок пользования имуществом, который может точно не соответствовать долям в праве общей собственности, нуждаемость каждого из сособственников в этом имуществе и реальную возможность совместного пользования.

Надо составлять исковое заявление, подавать его в суд, ходить на судебные заседания. При грамотном ведении дела больше вероятность, что суд примет именно то решение, которое Вас устроит. Обращайтесь - поможем.