Договор поставки был заключен на основании конкурса 26 мая 2010 согласно спецификации срок поставки 30 мая 2010

В случае просрочки исполнения поставщиком (исполнителем, подрядчиком) обязательства, предусмотренного государственным или муниципальным контрактом, заказчик вправе потребовать уплату неустойки (штрафа, пеней). Неустойка (штраф, пени) начисляется за каждый день просрочки исполнения обязательства, предусмотренного государственным или муниципальным контрактом, начиная со дня, следующего после дня истечения установленного государственным или муниципальным контрактом срока исполнения обязательства. Размер такой неустойки (штрафа, пеней) устанавливается государственным или муниципальным контрактом в размере не менее одной трехсотой действующей на день уплаты неустойки (штрафа, пеней) ставки рефинансирования Центрального банка Российской Федерации. Поставщик (исполнитель, подрядчик) освобождается от уплаты неустойки (штрафа, пеней), если докажет, что просрочка исполнения указанного обязательства произошла вследствие непреодолимой силы или по вине заказчика.

При заключении и исполнении государственного или муниципального контракта изменение условий контракта, означенных выше по соглашению сторон и в одностороннем порядке не допускается

Татьяна, нарушение срока поставки имело до момента изменения договора. И, кстати, формулировка "договор продлевался" ни о чём не говорит: можно продлить срок действия договора, можно - срок поставки. Если в самом договоре указано, что "договор продлевается", результатом будет только продление срока действия.