Как обособить три центра в составе юридического лица без потери статуса - варианты и их особенности

Филиал — обособленное подразделение юридического лица, расположенное вне места его нахождения и осуществляющее все его функции или их часть, в том числе функции представительства. Филиалы не являются юридическими лицами. Они наделяются имуществом создавшим их юридическим лицом и действуют на основании утвержденных им положений. Руководители филиалов назначаются юридическим лицом и действуют на основании его доверенности. Сведения о филиалах должны быть указаны в учредительных документах создавшего их юридического лица. Филиалы действуют на основании положений о филиалах, которые утверждаются органами юридического лица.

Представительство — обособленное подразделение юридического лица без прав юридического лица, расположенное вне места его нахождения, которое представляет интересы юридического лица и осуществляет их защиту. Представительства наделяются имуществом создавшим их юридическим лицом и действуют на основании утверждённых им положений. Руководители представительств назначаются юридическим лицом и действуют на основании его доверенности. Сведения о представительствах должны быть указаны в учредительных документах создавшего их юридического лица.

Департамент немного не подходит, поскольку это скорее всего относится к государственным органам.

Чтобы получить наибольшую самостоятельность вашим центрам, можно создать дочерние общества, учредителем которых будет основная фирма.