Льготный отпуск заканчивается 30 декабря если я вернусь в январе т.к 1 по 10 января выходные оплатят ли мне билеты.

Обычно в коллективном договоре или отдельном акте работодателя указывается, что льготный проезд предоставляется на время отпуска. Я бы не рисковал и приобрел бы билет с датой приезда, которая приходится на период отпуска. Кроме того, 1 января это уже не день отпуска, а день выходного дня.