Можно ли лишить отца родительских прав после невыплаты алиментов и последующего погашения задолженности?

Основания есть, в суд обратитесь.

Статья 69. Лишение родительских прав

[Семейный кодекс РФ] [Глава 12] [Статья 69]

Родители (один из них) могут быть лишены родительских прав, если они:

уклоняются от выполнения обязанностей родителей, в том числе при злостном уклонении от уплаты алиментов;

отказываются без уважительных причин взять своего ребенка из родильного дома (отделения) либо из иной медицинской организации, воспитательного учреждения, организации социального обслуживания или из аналогичных организаций;

злоупотребляют своими родительскими правами;

жестоко обращаются с детьми, в том числе осуществляют физическое или психическое насилие над ними, покушаются на их половую неприкосновенность;

являются больными хроническим алкоголизмом или наркоманией;

совершили умышленное преступление против жизни или здоровья своих детей, другого родителя детей, супруга, в том числе не являющегося родителем детей, либо против жизни или здоровья иного члена семьи.

Инна, основания есть для лишения родительских прав, необходимо обращаться в суд, только что вам это даст, чего вы хотите добиться?

Здравствуйте! Судя по практике с первого раза не лишают. У меня был такой опыт, практически аналогичная ситуация. Лучше сначала попробуйте ограничить его в родительских правах, а потом по истечении некоторого времени лишить этого права.