Как узаконить и внести изменения в ЕГРН после завершения (реконструкции) строительства частного жилого дома

Что же нам теперь делать?

Это большой вопрос. Начинать нужно было с межевания. Потом проектировать и строить с соблюдением всех СНИПов.

Замечательно, что зарегино хоть что-то (ИЖД) до того, как "всплыло".

По ситуации. Изготовить тех. паспорт по фактическому состоянию - не проблема. Любая организация (кроме БТИ) Вам окажет такую услугу, указав в ТП, что построено без предъявления разрешительных документов. На основе такого ТП (с особыми отметками) изменения в документы обязательного кадастрового учёта (в кадастровый паспорт) и в ЕГРН не внесут. С таким ТП в суд выходят признавать ПС на самовольную постройку (ИЖД в реконструированном виде). Поскольку у Вас отсутствие межевания "всплыло", то откажут и там... Сами себе проблемы создали.

Если ещё не все органы о Вашей истории осведомлены с Ваших же слов, то попробуйте схитрить. В местной Главархитектуре согласуйте проект реконструкции, получив разрешение на Реконструкцию, как будто Вы её не делали. Не пытайтесь сделать это самостоятельно ("засыпитесь"!) - обратитесь в небольшую частную проектную организацию (имеющую членство в СРО) - не ГУП, не МУП, но ООО. (В ОГУП БТИ тоже не ходите). Вам всё по документам проведут.

Сделают Вам сначала тех. паспорт "до" с проектом реконструкции. Получат разрешение на реконструкцию. Потом сделают тех. паспорт "после" ("чистый" - без особых отметок). Получат разрешение на ввод объекта в эксплуатацию. На него основании и на основании ТП "после реконструкции"внесёте изменения в кадастровый учёт и ЕГРН с получением новых доков (кадастрового паспорта и выписки из ЕГРН). Про межевание забудьте.