Как заставить наследника акционера зарегистрировать изменения у реестродержателя, несмотря на отказ налоговой из-за отсутствия паспортных данных наших сотрудников?

Во первых необходимо понять вступил ли наследник в права на акции. Если для деятельности предприятия отсутствие сведений в реестре акционеров создает препятствия, то необходимо обращаться в суд. Если же не создает - по большому счету реализация права - это проблема акционера, но не предприятия. Просто для подготовки собраний направляйте уведомления по реквизитам, указанным в реестре. Но в любом случае эта консультация предварительная. Полная и обоснованная может быть дана после изучения документов и сложившихся у Вас правоотношений.