Сильная кибератака на компьютер с важными документами - как зарегистрировать инцидент и как это может помочь?

В принципе, ничего страшного не случиться, если уполномоченное лицо Вашей организации обратится в органы МВД с заявлением об установлении и привлечении к уголовной ответственности неизвестных лиц, которые создали и распространили вредоносную компьютерную программу, причинившую такой-то ущерб (ст. 273 УК РФ).

До обращения в полицию необходимо письменно зафиксировать факт выхода из строя программного обеспечения (докладные сотрудников, акт о признаках вирусной атаки и её последствиях со стороны сисадмина, приказ по организации о вирусной атаке и её последствиях, перечислив среди них те, которые помешают своевременно и полно сдать налоговую отчётность, и пр..). Удалять вирусы и лечить заражение в данном случае не стоит, т.к. компьютерную технику необходимо будет передать сотрудникам для производства технической экспертизы в целях установления факта заражения (как вариант, можно самим инициировать и оплатить производство данной экспертизы в соответствующем экспертном учреждении и приложить заключение к заявлению).

В дальнейшем необходимо будет подготовить обращение в налоговую с приложением к нему соответствующих документов и копии постановления (о возбуждении уголовного дела или об отказе в таковом) и надеяться на понимание)))

P.S. Передавая оргтехнику в органы полиции, нужно быть уверенным в том, что всё установленное у Вас программное обеспечение легально. В противном случае уголовное дело могут возбудить в отношении Вас.