Как бороться с возражениями по иску о возмещении морального вреда при производственной травме в связи с отсутствием компенсации в коллективном договоре?

Сроки давности не распространяются на требовании о взыскании морального вреда ст. 208 ГК РФ

коллективный договор тут совершенно не причем, ссылайтесь на ст. 151 ГК РФ - закон дает право на подачу иска в вашем случае.

Написанное в возражения не является основания для отказа в иске. Помимо морального вреда Вы также можете взыскать не полученный доход за 3 последние года и на будущее

Статьей 1085 ГК РФ установлено, что при причинении гражданину увечья или ином повреждении его здоровья возмещению подлежит утраченный потерпевшим заработок (доход), который он имел либо определенно мог иметь.

В соответствии с ч. 1 ст. 1086 ГК РФ размер подлежащего возмещению утраченного потерпевшим заработка (дохода) определяется в процентах к его среднему месячному заработку (доходу) до увечья или иного повреждения здоровья либо до утраты им трудоспособности, соответствующих степени утраты потерпевшим профессиональной трудоспособности, а при отсутствии профессиональной трудоспособности - степени утраты общей трудоспособности.

Согласно п. 3 ст. 8 Федерального закона от 24 июля 1998 г. N 125-ФЗ "Об обязательном социальном страховании от несчастных случаев на производстве и профессиональных заболеваний" «...Возмещение застрахованному морального вреда, причиненного в связи с несчастным случаем на производстве или профессиональным заболеванием, осуществляется причинителем вреда».