Можно ли заключить договор аренды кафе как физ. лицо, без ИП.

Можно, но не стоит. Потому как если Вами будет избрана система налогообложения в виде УСН (с объектом доход - расход, более внимательно см. п. 1 ст. 346.16 НК РФ), то Вы получите возможность отнести расходы на аренду кафе (помещение + оборудование) в расходную часть, тем самым снизив (а то и вовсе "занулив") налогооблагаемую базу. Но это при условии, если заключите договор именно как ИП. А если как частное лицо - данная возможность будет Вами утрачена. Делайте выводы.