Юристы, помогите разобраться! Как анулировать данные в ЕГРН и оформить землю после ошибки Администрации?

Если на этом участке стоит чужой дом, то это вообще усложняет ситуацию и нужно решать вопрос с этим домом. В настоящее время не может быть разных собственников на дом и землю при оформлении объектов недвижимости.

Все зависит от актуальных записей в ЕГРН относительно зарегистрированных прав собственника земельного участка. Наличие свидетельства, которое Вы нашли, ни о чем не говорит, это может быть и старое (т.н. розовое" свидетельство). В этом случае, собственник вправе был обратиться в Росреестр за подтверждением ранее возникших прав. Но главное, имеется ли в настоящее время запись в ЕГРН именно о праве собственности, на кадастровом учете объекты и так должны быть.

Если нет актуальных записей в ЕГРН о зарегистрированных правах на земельный участок, а у Вас зарегистрировано право собственности на жилой дом (т.к. Вы сами указали, что "является собственником"), Вы вправе (исходя из принципа единства судьбы земельного участка и находящегося на нем объекта недвижимого имущества - ЗК РФ) подать исковое заявление о признании права собственности на спорный земельный участок. Также при необходимости, можно заявить о погашении записей в ЕГРН, которые препятствуют регистрации (Росреестр должен быть привлечен в качестве 3-го лица). Вступившее в силу решение суда будет являться основанием для госрегистрации права и погашения записей в ЕГРН.