Как пересекать границу с автомобилем, зарегистрированным в другой стране и используемым при наличии двух гражданств?

Если на время, то не нужно. Просто авто будет находиться под режимом временного ввоза согласно ст.219, 264 Таможенного кодекса Евразийского экономического союза (приложение N 1 к Договору о Таможенном кодексе Евразийского экономического союза от 11 апреля 2017 г.). Если насовсем, то нужно будет растоможить.

Статья 264. Временный ввоз транспортных средств для личного пользования Таможенного кодекса Евразийского экономического союза:

1. Допускается временный ввоз на таможенную территорию Союза иностранными физическими лицами транспортных средств для личного пользования, зарегистрированных в государстве, не являющемся членом Союза, на срок не более 1 года.

Никаких таможенных действий не надо.

Россия не признает никакого двойного гражданства. ВЫ для России - гражданин России.

Согласно ст.264 Таможенного кодекса Евразийского экономического союза:

1. Допускается временный ввоз на таможенную территорию Союза иностранными физическими лицами транспортных средств для личного пользования, зарегистрированных в государстве, не являющемся членом Союза, на срок не более 1 года.

Но поскольку вы являетесь гражданином РФ и не являетесь иностранным физическим лицом по смыслу Кодекса, то в данном случае вы не можете ввезти данный авто без уплаты таможенных платежей. То же самое касается и лиц, имеющих вид на жительство в России.

Уже отвечали на подобные вопросы много раз.

Вот так вот.