Как военному пенсионеру получить субсидию и сохранить права на долю квартиры родителей?

В таком случае Вы можете не вступать в наследство чтобы не произвести действия приводящие к намеренному ухудшению жилищных условий (53 ЖК РФ). Тем более если доля вам не нужна.

ЖК РФ Статья 53. Последствия намеренного ухудшения гражданами своих жилищных условий

Граждане, которые с намерением приобретения права состоять на учете в качестве нуждающихся в жилых помещениях совершили действия, в результате которых такие граждане могут быть признаны нуждающимися в жилых помещениях, принимаются на учет в качестве нуждающихся в жилых помещениях не ранее чем через пять лет со дня совершения указанных намеренных действий.

Поговорите с мамой. Пусть она, как опекун отца, отменит завещание в соответствии со ст. 1130 ГК РФ, да и все.

Вы можете отказаться от наследства в пользу мамы в соответствии со ст. 1157,

Отказ от наследства возможно осуществить способами, предусмотренными ст 1159 ГК РФ

Статья 1159. Способы отказа от наследства

1. Отказ от наследства совершается подачей по месту открытия наследства нотариусу или уполномоченному в соответствии с законом выдавать свидетельства о праве на наследство должностному лицу заявления наследника об отказе от наследства.

2. В случае, когда заявление об отказе от наследства подается нотариусу не самим наследником, а другим лицом или пересылается по почте, подпись наследника на таком заявлении должна быть засвидетельствована в порядке, установленном абзацем вторым пункта 1 статьи 1153 настоящего Кодекса.

3. Отказ от наследства через представителя возможен, если в доверенности специально предусмотрено полномочие на такой отказ. Для отказа законного представителя от наследства доверенность не требуется.