Как выбрать наиболее выгодный вариант ухода из организации - через сокращение или договоренность сторон?

Здравствуйте. "По согласованию сторон" - такого основания увольнения нет. Правильно - по соглашению сторон (ст. 78 ТК РФ).

А уж какое соглашение может быть достигнуто - решать только работнику и работодателю. Если работодатель предложит сумму не намного меньше той, что Вы можете получить как выходное пособие по увольнению при сокращении штата (ст. 178 ТК РФ), может быть выгоднее уволиться по соглашению - всю сумму должны получить сразу (но не факт, что получите - тут важны верные формулировки в соглашении, чтобы не дали работодателю возможности не исполнить обещанное). Но при этом у Вас сразу и работы не станет.

При увольнении по сокращению Вы еще два месяца можете работать и искать другую работу, подготовиться морально к увольнению.

Надо учитывать, что гарантированно при увольнении по сокращению Вы получите только средний заработок за первый месяц после увольнения; за второй - только в случае, если не сможете трудоустроиться, за третий - если вовремя встанете на учет в ЦЗ, будете соблюдать правила учета (ходить отмечаться и тд.), будут в наличии исключительные обстоятельства, при которых ЦЗ выдаст решение о продлении выплаты на третий месяц нетрудоустройства.