Отказ бенифициарного владельца ООО в предоставлении отпуска - правомерность и возможности защиты

Никуда.

Потому что Вы директор ООО и Вы сами решаете когда Вам работать и когда идти в отпуск.

Трудове законодательство тут не нарушено.

У Вас неформальные отношения по этому поводу.

Вы можете уйти с этой должности.

Особенности Ваших отношений урегулированы гл. 43 ТК РФ.

Согласно ст. 122 ТК РФ оплачиваемый отпуск должен предоставляться работнику ежегодно. Перенос отпуска допускается только с согласия работника (п.3 ст 24 ТК) Обратиться нужно в трудовую инспекцию.

А зачем Вам разрешение учредителя, директор является исполнительным органом, Вы имеете полное право издать приказ и отпустить себя в отпуск, на пишите, какими внутренними документами регулируются отношения с учредителем, это из области корпоративного права. НО формально, по Закону об ООО, вам разрешение не нужно.

Статья 40. Единоличный исполнительный орган общества

Путеводитель по корпоративным спорам. Вопросы толкования и применения ст. 40

1. Единоличный исполнительный орган общества (генеральный директор, президент и другие) избирается общим собранием участников общества на срок, определенный уставом общества, если уставом общества решение этих вопросов не отнесено к компетенции совета директоров (наблюдательного совета) общества. Единоличный исполнительный орган общества может быть избран также не из числа его участников.