Проблемы с внедрением IT поддержки на базе 1С - как решать некорректность данных и отклонения в производственных процессах?

Фирма, где я работаю, образовалось путем выделения из состава более крупного предприятия. Соответственно вся подготовка и организация производственных процессов началась практически с нуля. В том числе и IT поддержка на базе 1 С. Руководством был нанят подрядчик для наладки и внедрения 1 с упп. Процесс начался с января месяца, поэтому можно сказать, что в этом месяце учет движения всех ТМЦ как внутри фирмы, так и за ее пределы в 1 с отсутствовал, сотрудниками велся учет в ручном режиме на бумажных носителях. Также в этот период подрядчиком производились какие то действия в 1 с по передвижениям тмц, оформлялись различные отчеты. Где то от своего имени, где то под учетными записями наших сотрудников, без их уведомления и согласия. Подрядчик наладил в 1 с возможность оформления некоторых отчетов по движению тмц, но общий механизм управления производственным предприятием, по состоянию на 22 июня, отсутствует. Нам, рядовым пользователям 1 с упп, не известно, на каком этапе все остановилось, что работает, а что нет. Не было передано ни одной инструкции. Понимания как работать у нас нет в принципе. В апреле месяце подрядчик исчез, по неизвестным нам причинам. Может по своей воле, может с ним не производили расчетов, по причине отсутствия результата, информации нет. По решению руководства, по состоянию на 1 мая, было принято решения провести тотальную инвентаризацию, с целью принятия ее фактических результатов за точку отсчета. Так была озвучена цель пересчета нашим руководством. Остатки незавершенного производства и ТМЦ были посчитаны и значения введены в 1 с. Естественным образом, учитывая манипуляции в системе представителем подрядчика, получились отклонения фактических результатов от данных 1 с, как в большую, так и в меньшую сторону. Руководство потребовало от нас анализа отклонений. Мы провели такой анализ, по результатам которого были выявлены различные причины документальных отклонений, но коренной причиной являлась некорректность данных 1 с. Такие объяснения не устроили экономистов предприятия, при этом других причин в ряде случаев они и сами не могут предоставить. Более того руководителем, которому непосредственно подчинено IT (странным образом у нас это опять руководитель экономистов), утверждается, что система 1 сс упп рабочая! Странно! Более того намекают на проверку службой экономической безопасности «наших» отклонений. Подскажите пожалуйста как действовать в этой ситуации?