Как оспорить экспертизу ФБУ лаборатории экспертизы Минюста России в суде?

Никак, это просто доказательство по делу, оно опровергается другими доказательствами.

Здравствуйте, вы должны были экспертизу оспаривать в суде в рамках дела по которому было вынесено решение. Отдельно экспертизу вы не оспорите. Сейчас вам сложно будет, что либо сделать.

Но вы можете попробывать следующее:

В связи с вопросами, возникающими у судов при применении норм главы 42 Гражданского процессуального кодекса Российской Федерации (далее - ГПК РФ) о пересмотре по вновь открывшимся или новым обстоятельствам судебных постановлений, вступивших в законную силу, а также в целях обеспечения правильного применения законодательства и единства судебной практики Пленум Верховного Суда Российской Федерации, руководствуясь статьей 126 Конституции Российской Федерации, статьями 9, 14 Федерального конституционного закона от 7 февраля 2011 года N 1-ФКЗ "О судах общей юрисдикции в Российской Федерации", постановляет дать судам следующие разъяснения:

1. Вступившие в законную силу решения судов первой инстанции, определения судов апелляционной инстанции, постановления и определения судов кассационной инстанции, постановления Президиума Верховного Суда Российской Федерации могут быть пересмотрены по вновь открывшимся или новым обстоятельствам судом, принявшим постановление.

Если по этим основаниям не получится, то тогда только через ВС РФ.