Какие проблемы могут возникнуть при определении права пользования комнатой и возможно ли это вообще при таких вводных?

Прописка правового значения в данном случае не имеет, других родственников в том числе.

Порядок пользования жилым помещением определяется между участниками общей долевой собственности. Учёт интересов членов семьи сособственников гражданским законодательством не предусмотрен, поскольку их право пользования принадлежащим собственнику жилым помещением производно от прав собственника и урегулировано жилищным законодательством.

Вот вселиться и занять комнату было бы неплохо, т.к. учитывается сложившийся порядок пользования.

Как разъяснил Пленум ВС РФ и Пленум ВАС РФ в п. 37 Постановления N 6/8 от 1 июля 1996 г. "О некоторых вопросах, связанных с применением части первой Гражданского кодекса Российской Федерации": «Невозможность раздела имущества, находящегося в долевой собственности, в натуре либо выдела из него доли, в том числе и в случае, указанном в ч.2 п. 4 ст. 252 ГК РФ, не исключает права участника общей долевой собст-венности заявить требование об определении порядка пользования этим имуществом, ес-ли этот порядок не установлен соглашением сторон.

Разрешая такое требование, суд учитывает фактически сложившийся порядок поль-зования имуществом, который может точно не соответствовать долям в праве общей соб-ственности, нуждаемость каждого из сособственников в этом имуществе и реальную возможность совместного пользования».