Проживаю в коммунальной квартире, собственник одной комнаты вторую занимаю, хотел бы оформить вторую комнату.

Указанная Вами комната занята Вами самовольно, она не является ни свободной, ни освободившейся, поскольку в ней зарегистрирован по месту жительства сосед, которого Вы давно не видели. Согласно ст. 71 ЖК РФ само по себе временное отсутствие нанимателя жилого помещения по договору социального найма, кого-либо из проживающих совместно с ним членов его семьи или всех этих граждан не влечет за собой изменение их прав и обязанностей по договору социального найма. Признать нанимателя безвестно отсутствующим (ст.42 ГК РФ) или объявить его умершим в судебном порядке (ст.45 ГК РФ) может также наймодатель, а также Вы, если претендуете на получение комнаты или её выкуп.

В соответствии со ст.83 ЖК РФ в случае выезда нанимателя и членов его семьи в другое место жительства договор социального найма жилого помещения считается расторгнутым со дня выезда, что может быть установлено решением суда по иску наймодателя. Невнесение нанимателем платы за жилое помещение и (или) коммунальные услуги в течение более шести месяцев также является в соответствии с названной статьёй основанием к расторжению договора соцнайма наймодателем. Согласно ст.90 ЖК РФ если наниматель и проживающие совместно с ним члены его семьи в течение более шести месяцев без уважительных причин не вносят плату за жилое помещение и коммунальные услуги, они могут быть выселены в судебном порядке также по иску наймодателя с предоставлением другого жилого помещения по договору социального найма, размер которого соответствует размеру жилого помещения, установленному для вселения граждан в общежитие.

В соответствии с ч.1 ст.59 ЖК РФ освободившееся жилое помещение в коммунальной квартире, в которой проживают несколько нанимателей и (или) собственников, на основании их заявления предоставляется по договору социального найма проживающим в этой квартире нанимателям и (или) собственникам, если они на момент освобождения жилого помещения признаны или могут быть в установленном порядке признаны малоимущими и нуждающимися в жилых помещениях (относитесь ли Вы к таким лицам нельзя определить по тексту вопроса). При отсутствии в коммунальной квартире граждан, указанных в части 1 ст.59 ЖК РФ, освободившееся жилое помещение предоставляется по договору социального найма проживающим в этой квартире нанимателям и (или) собственникам, которые могут быть в установленном порядке признаны малоимущими и которые обеспечены общей площадью жилого помещения на одного члена семьи менее нормы предоставления, на основании их заявления. При отсутствии в коммунальной квартире граждан, указанных в частях 1 и 2 настоящей статьи, освободившееся жилое помещение предоставляется по договору купли-продажи гражданам, которые обеспечены общей площадью жилого помещения на одного члена семьи менее нормы предоставления, на основании их заявления. При отсутствии в коммунальной квартире граждан, указанных в частях 1 - 3 настоящей статьи, вселение в освободившееся жилое помещение осуществляется на основании договора социального найма в порядке, предусмотренном ЖК РФ, то есть оно будет предоставлено другим лицам.