Как уволиться по не годности к плавсоставу при ситуации окончания контракта?

Ваши права и ОБЯЗАННОСТИ регулируются ФЗ "О статусе военнослужащих" и ФЗ "О воинской обязанности и военной службе", для того, чтобы знать о своих правах и ОБЯЗАННОСТЯХ изучите указанные нормативные акты

Что касается вашей ситуации, то согласно

под б п. 3 ст. 51 Федеральный закон от 28.03.1998 N 53-ФЗ (ред. от 25.11.2013) "О воинской обязанности и военной службе" (с изм. и доп., вступающими в силу с 01.01.2014)

Военнослужащий, проходящий военную службу по контракту, имеет право на досрочное увольнение с военной службы:

б) по состоянию здоровья - в связи с признанием военно-врачебной комиссией ограниченно годным к военной службе (за исключением лиц, указанных в подпункте "г" пункта 1 настоящей статьи);

ст. 5.1. ФЗ №53-ФЗ 1. Граждане при постановке на воинский учет, призыве или поступлении на военную службу по контракту, поступлении в мобилизационный людской резерв, поступлении в военные профессиональные образовательные организации и военные образовательные организации высшего образования, призыве на военные сборы, прохождении альтернативной гражданской службы, а также граждане, ранее признанные ограниченно годными к военной службе по состоянию здоровья, проходят медицинское освидетельствование врачами-специалистами: терапевтом, хирургом, невропатологом, психиатром, окулистом, оториноларингологом, стоматологом, а в случае необходимости - врачами других специальностей. По согласованию с командиром (начальником) воинской части (военно-медицинской организации) для медицинского освидетельствования указанных граждан могут привлекаться военные врачи-специалисты.

Порядок прохождения освидетельствования установлен Постановление Правительства РФ от 04.07.2013 N 565 "Об утверждении Положения о военно-врачебной экспертизе"

Вообщем вам необходимо в госпитале заявить о прохождении медицинского освидетельствования о признании вас ограниченно годным к службе. Вам разъяснят дальнейшие ваши действия.