Могут ли признать данную ситуацию самостроем и не выдать разрешение на строительство?

Доброго времени суток! Начал строительство дома во время получения разрешения на строительство (т.е. параллельно). На этапе согласования плана строения и расположения его на участке возникли вопросы по наличию строения (к этому моменту был готов только фундамент и подземный цокольный этаж). Могут ли признать данную ситуацию самостроем и не выдать разрешение на строительство? PS план строения соответствует построенному, фундамент расположен ближе 3 метров к границе участка с соседями, но имеется от них разрешение на строительство.