Какой срок владения квартирой считается при продаже, если часть квартиры унаследована, а другая часть - в собственности уже давно?

Согласно пп.1.п. 1 ст. 220 Налогового Кодекса -при реализации имущества, находящегося в общей долевой собственности соответствующий размер имущественного налогового вычета исчисленного в соответствии с указанным подпунктом, распределяется между совладельцами этого имущества пропорционально их долям.

Согласно ст. 235 ГК РФ изменение состава собственников, в том числе переход имущества к одному из участников общей долевой собственности не влечет для этого лица прекращения права собственности на указанное имущество.

Согласно ст. 131 ГК РФ при изменении состава имущества необходима государственная регистрация изменения.

В связи с этим моментом возникновения права собственности у участника общей долевой собственности на квартиру является не дата повторного получения свидетельства о праве собственности на имущество в связи с изменением состава собственников квартиры и долей в праве собственности на квартиру, а момент первоначальной государственной регистрации права собственности на данную квартиру.

Так как квартира(часть ее) находилась уже у Вас в собственности более 3х лет, изменились только доли собственников, то с дохода от квартиры НДФЛ не взимается.

Таким образом в договоре купли-продажи можно указать полную стоимость и 3-х лет ждать при этом необязательно.

(Письмо Министерства Финансов РФ от 6 июля 2011 г. N 03-04-05/7-486)