Работаю водителем, по приезду на базу в путевом листе пишу время прибытия 17:00 а фактическое время прибывания позже.

Все зависит от того как Вы оформлены:

- нормальная продолжительность рабочего дня - на то время когда Вы возвращаетесь позже у Вас идет переработка, которая оплачивается в повышенном размере (ст. 152 ТК РФ - первые 2 часа в полуторном размере, свыше - в двойном).

- ненормированный рабочий день - в этом случае время возврата в гараж роли не играет.

Уточните какой у вас режим рабочего времени.