Я продаю комнату в коммунальной квартире за 728000 рублей и у меня доля квартиры.

Судя по тексту вопроса, ничего считать не надо - налоговый вычет предоставляется на всю сумму, т.к. она меньше предельного размера (1 млн.руб).

Но продаете Вы либо комнату - как отдельный материальный объект, на который у Вас имеется свидетельство о собственности на объект. Либо долю в праве собственности на всю квартиру, о чем тоже должно быть свидетельство. Одновременно, в отношении этой квартиры, у Вас не может быть двух видов собственности.

НК РФ.

"Статья 220. Имущественные налоговые вычеты

1. При определении размера налоговой базы в соответствии с пунктом 2 статьи 210 настоящего Кодекса налогоплательщик имеет право на получение следующих имущественных налоговых вычетов:

1) в суммах, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи жилых домов, квартир, комнат, включая приватизированные жилые помещения, дач, садовых домиков или земельных участков и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика менее трех лет, но не превышающих в целом 1 000 000 рублей, а также в суммах, полученных в налоговом периоде от продажи иного имущества, находившегося в собственности налогоплательщика менее трех лет, но не превышающих 125 000 рублей. При продаже жилых домов, квартир, включая приватизированные жилые помещения, дач, садовых домиков и земельных участков и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика три года и более, а также при продаже иного имущества, находившегося в собственности налогоплательщика три года и более, имущественный налоговый вычет предоставляется в сумме, полученной налогоплательщиком при продаже указанного имущества".