Срок действия паспорта РФ давно истёк, можно его восстановить или надо заново получать гражданство?

Я проживаю в РФ с 2000 года В 2000 году я женился на гражданке РФ в г.Волгограде. В 2001 году родился сын. Был выдан вид на жительство до 2009г. Вид на жительство не смог продлить т.к. истёк срок действия паспорта гр.Литвы. Паспорт был восстановлен в консульстве в 2011году. Однако по сегодняшний день ФМС отказывает принять документы о продлении вида на жительство на основании изменения места жительства (в пределах одного города и района). Говорят что надо выехать из РФ и снова въехать через границу. Как мне получить гражданство РФ?