Изменение участника ООО в ИФНС было зарегистрировано,

Решение вопроса о том, кто остался единственным участником и, соответственно, на чью долю достались проблемы, зависит от факта: от кого ранее поступило заявление о выходе и как это задокументировано. Если заявление второго участника поступило в общество раньше вашего заявления, то он считается выбывшим из состава участников в силу положений ст. 26 Закона "Об обществах с ограниченной ответственностью" - и наоборот.

То, что изменения учр. документов о выходе второго участника не зарегистрированы, в целях определения прав бывшего участника не имеет правового значения, опять же в силу ст. 26 Закона об ООО. Дело в том, что согласно указанной статье участник считается выбывшим с момента подачи (получения обществом или участниками) письменного заявления о выходе, независимо от согласия общества или участников. Факт регистрации выхода или отсутствия регистрации никак не изменяет этот порядок.

Что касается директора, то если он уволен в установленном порядке, то также нет никаких оснований для возложения на него проблем, которые возникли после даты его увольнения. Общество или участники не вправе запретить директору досрочно расторгнуть трудовой договор, поэтому проведения общего собрания по этому вопросу не требуется (ст. 280 ТК РФ). Регистрация смены руководителя носит уведомительный характер, а не разрешительный.

К сожалению, в данной ситуации, если вы фактически единственный участник, то вам и решать возникшие проблемы. В этой ситуации вам нужно или назначить нового директора или принять на себя эти полномочия и уведомить регистрирующий орган для изменений сведений в ЕГРЮЛ.Это позволит вам осуществлять конкретные действия по претензиям и искам. И вы сможете обратиться в суд с иском к бывшему директору об обязании вернуть учр. документы и печать, которые он неправомерно удерживает. Дело в том, что в отсутствие руководителя с подтвержденными полномочиями общество не может выступить ни истцом ни ответчиком, а также подать отчетность в налоговую.

С уважением,