Меня попросили "на всякий случай написать заявление об отпуске, на случай если со мной что-либо случится".

Для начала.

Вы должны были лично выполнять трудовую функцию, ст. 56 ТК РФ.

Тот факт, что кто-то за Вас работал, расписывался и пр. Вам не наруку, даже можно сказать против Вас. Поэтому данную тему лучше не поднимать.

Остается разобраться с отпуском. Если Вы (или Ваш "двойник-представитель" действительно получали суммы отпускных, то это ничего не значит, пускай отпуск предоставлялся даже авансом. Работодатель может удержать с Вас при увольнении денежные средства в счет неотработанного отпуска, ст. 137 ТК РФ -

Удержания из заработной платы работника для погашения его задолженности работодателю могут производиться:

при увольнении работника до окончания того рабочего года, в счет которого он уже получил ежегодный оплачиваемый отпуск, за неотработанные дни отпуска. Удержания за эти дни не производятся, если работник увольняется по основаниям, предусмотренным пунктом 8 части первой статьи 77 или пунктами 1, 2 или 4 части первой статьи 81, пунктах 1, 2, 5, 6 и 7 статьи 83 настоящего Кодекса.

Однако, наличие задолженности не лишает вас права уволиться в ЛЮБОЕ время по собственному желанию, ст. 80 ТК РФ.

причем работодатель даже не сможет с Вас взыскать сумму задолженности через суд, т.к. таковой возможности трудовой кодекс не предусматривает.

Таким образом, в отпуске с последующим увольнением Вам отказали правомерно, т.к. по бумагам в отпуске Вы уже были. Вы имеете право уволиться по собственному желанию.