Значит ли это, что повышение зарплаты не распространяется на человека, работающего на такой ставке?

Такого понятия как "замороженная" ставка не существует. Если работодатель производит повышение заработной платы для ВСЕХ сотрудников, то он обязан сделать это и в отношении работников работающих на период отсутствия основного работника.

Если с вами заключен срочный трудовой договор на период отсутствия основного работника на период его нахождения в декретном отпуске и (или) отпуске по уходу за ребенком до 3-х лет, то на Вас распространяются все льготы, гарантии и компенсации предусмотренные ТК РФ.

Если в период срока действияи Вашего срочного трудового договора Вы забеременеете, то работодатель МОЖЕТ расторгнуть с Вами срочный трудовой договор только по окончанию Вашей беременности, даже если основной работник уже выйдет на работу, сам договор должен быть продлен, минимум, до окончания беременности, ст. 261 ТК РФ -

Расторжение трудового договора по инициативе работодателя с беременными женщинами не допускается, за исключением случаев ликвидации организации либо прекращения деятельности индивидуальным предпринимателем.

В случае истечения срочного трудового договора в период беременности женщины работодатель обязан по ее письменному заявлению и при предоставлении медицинской справки, подтверждающей состояние беременности, продлить срок действия трудового договора до окончания беременности. Женщина, срок действия трудового договора с которой был продлен до окончания беременности, обязана по запросу работодателя, но не чаще чем один раз в три месяца, предоставлять медицинскую справку, подтверждающую состояние беременности. Если при этом женщина фактически продолжает работать после окончания беременности, то работодатель имеет право расторгнуть трудовой договор с ней в связи с истечением срока его действия в течение недели со дня, когда работодатель узнал или должен был узнать о факте окончания беременности.

Допускается увольнение женщины в связи с истечением срока трудового договора в период ее беременности, если трудовой договор был заключен на время исполнения обязанностей отсутствующего работника и невозможно с письменного согласия женщины перевести ее до окончания беременности на другую имеющуюся у работодателя работу (как вакантную должность или работу, соответствующую квалификации женщины, так и вакантную нижестоящую должность или нижеоплачиваемую работу), которую женщина может выполнять с учетом ее состояния здоровья. При этом работодатель обязан предлагать ей все отвечающие указанным требованиям вакансии, имеющиеся у него в данной местности. Предлагать вакансии в других местностях работодатель обязан, если это предусмотрено коллективным договором, соглашениями, трудовым договором.

Расторжение трудового договора с женщинами, имеющими детей в возрасте до трех лет, одинокими матерями, воспитывающими ребенка в возрасте до четырнадцати лет (ребенка-инвалида до восемнадцати лет), другими лицами, воспитывающими указанных детей без матери, по инициативе работодателя не допускается (за исключением увольнения по основаниям, предусмотренным пунктами 1, 5 - 8, 10 или 11 части первой статьи 81 или пунктом 2 статьи 336 настоящего Кодекса).

при этом все обязательные выплаты (пособие например) должны быть произведены работодателем в любом случае.