Влияет ли сокращение доходов налоговые обязательства при получении определенной суммы военнослужащим?

В вашем случае имеет место не сокращение доходов, а увеличение расходов.

Расходы на наем жилья не указаны в числе налоговых вычетов, принимаемых при исчислении налога на доходы физических лиц.

Вместе с тем, отдельным категориям военнослужащих нормативными актами установлены компенсационные выплаты за наем жилья.