Проверка на наличие лицензии в магазине авто-запчастей - возможно ли признание результатов незаконными?

Вы были бы правы, если бы на момент составления протокола представили доказательства надлежащей продажи лекарственных средств, находящихся в аптечке.

Вам вменяется не продажа аптечек, а незаконная продажа их содержимого - лекарственных средств.

Не знали? Это - не аргумент!

Что касается закона от 14.07.2001 г. № 134-ФЗ, то положения этого закона не применяются к отношениям, связанным с проведением лицензионного контроля (пункт 3 закона).

Сложно ответить однозначно. Многое будет зависеть в т.ч. и от настроения судьи, ведущего дело. С одной стороны, нарушение Ваших прав налицо (непредъявление постановления о проведении проверки с указанием предмета проверки и т.д.), с другой - это нарушение не опровергает общей картины - а именно, отсутствия у Вас лицензии.

Попробуйте оспорить, тут разные исходы бывали. Тем более, что зацепиться Вам есть за что как в плане законодательства, так и в плане доказательной базы.

Не могу не согласиться со справедливым замечанием коллеги относительно изменений, внесённых в закон №134-ФЗ (позволил себе в спешке использовать старую брошюрку, а не систематически актуализируемый Консультант).

Вместе с тем, положения настоящего Федерального закона не применяются и к отношениям, связанным с проведением прокурорского надзора.

Из содержания вопроса следует, что в проверке принимала участие прокуратура и, следовательно, она законна.