В каком случае я больше юридически защищена, меньше плачу налоги и меньше рискую?

Все определяется, является ли квартира Вашей собственностью. Если нет, то у Вас нет оснований для получения денег за обмен муниципальной квартиры. Если приватизирована, то особой разницы нет, что будет купля-продажа или мена, на каких-то условиях. Правда при оформлении купли-продажи, Вы можете оформить стоимость по цене БТИ, т.е. минимальную, тогда и налоги будут меньше. Если подробнее, то обращайтесь по адресу: kuligin@rdn.ru