Могу ли я претендовать на получение сертификата и куда отправлять заявку.

Трудно сказать однозначно. По тексту вопроса - не имеете. Правила предусматривают именно научную деятельность, то есть стаж работы в должности научного работника (в вопросе речь идет о научно-педагогическом стаже).

Но право имеет любой молодой ученый, отвечающий установленным критериям, то есть ученый может работать в любой научной организации, ведомственная принадлежность не имеет значения.

Правила

предоставления молодым ученым социальных выплат на приобретение жилых помещений в рамках реализации мероприятий по обеспечению жильем отдельных категорий граждан федеральной целевой программы "Жилище" на 2002 - 2010 годы

(утв. постановлением Правительства РФ от 14 декабря 2006 г. N 765)

(с изменениями от 14 ноября 2007 г., 29 мая, 7 ноября 2008 г., 27 января 2009 г.)

"5. Молодой ученый может быть признан участником мероприятий, если:

его возраст не превышает 35 лет (для кандидатов наук) или 45 лет (для докторов наук) на день принятия решения о его включении в список молодых ученых - участников мероприятий;

стаж его работы в научной организации в должности научного работника составляет не менее 5 лет.

11. Выдача сертификатов молодым ученым осуществляется Российской академией наук, Дальневосточным, Сибирским и Уральским отделениями Российской академии наук, Российской академией медицинских наук и Федеральным агентством по науке и инновациям (далее - уполномоченная организация) в устанавливаемом ими порядке.

12. Для участия в мероприятиях молодой ученый подает в уполномоченную организацию следующие документы:

а) заявление на получение сертификата;

б) копии документов, подтверждающих наличие ученой степени;

в) копии документов, подтверждающих стаж работы в должности научного работника".