Особенности продажи квартиры с двумя собственниками - возможность применения налоговой схемы при продаже через ипотеку и материнский капитал

Хотим продать квартиру. Два собственника по 1/2 доли. В собственности менее 3-х лет. При продаже каждой доли отдельным договором - продавцы каждый должен заплатить 13% с суммы дохода свыше 1 млн. руб. Работает ли такая схема при продаже квартиры по ипотеке, материнскому капиталу и т.д.? С наилучшими пожеланиями, Дмитрий.