Как рассчитать время проживания по программе переселения соотечественников - от удостоверения переселенца или от паспорта РФ?

Исходя из смысла "определенного свидетельством участника Государственной программы, ранее чем через два года, участник Государственной программы и (или) члены его семьи возмещают в установленном порядке затраты, связанные с выплатой им единовременного пособия на обустройство («подъемных»)."

Начало течения срока берёт отсчет с момента получения удостоверения переселенца.