Можно ли уволить секретаря налоговой, чьему мужу предъявили обвинение, но рассматривается апелляция?

Нет не могут уволить вообще. Тем более даже в силу приговор не в ступил.

Статья 390. Вступление приговора в законную силу и обращение его к исполнению

[Уголовно-процессуальный кодекс РФ] [Глава 46] [Статья 390]

1. Приговор суда первой инстанции вступает в законную силу по истечении срока его обжалования в апелляционном порядке, если он не был обжалован сторонами.

2. Приговор суда апелляционной инстанции вступает в законную силу с момента его провозглашения и может быть пересмотрен лишь в порядке, установленном главами 47.1, 48.1 и 49 настоящего Кодекса.

3. В случае подачи жалобы, представления в апелляционном порядке приговор вступает в законную силу в день вынесения решения судом апелляционной инстанции, если он не отменяется судом апелляционной инстанции с передачей уголовного дела на новое судебное разбирательство либо с возвращением уголовного дела прокурору.

4. Приговор обращается к исполнению судом первой инстанции в течение 3 суток со дня его вступления в законную силу или возвращения уголовного дела из суда апелляционной инстанции.

Здравствуйте.Федеральным законом от 27.07.2004 N 79-ФЗ (ред. от 02.07.2013) "О государственной гражданской службе Российской Федерации" это не предусмотрено.

При продвижении по карьерной лестнице и трудоустройстве в связи с судимостью мужа проблемы не исключены. А вот уволить по причине того, что ваш супруг находится под следствием и т.п. вас не имеют права.