Можно ли уволить сотрудницу, работающую по срочному трудовому договору, по истечении срока договора?

Да. Конечно, предупредив работника за 3 дня до окончания срока договора.

ст. 79 ТК РФ.

Срочный трудовой договор прекращается с истечением срока его действия. О прекращении трудового договора в связи с истечением срока его действия работник должен быть предупрежден в письменной форме не менее чем за три календарных дня до увольнения, за исключением случаев, когда истекает срок действия срочного трудового договора, заключенного на время исполнения обязанностей отсутствующего работника.