Проблемы с приобретением нежилого здания для пекарни - противоречие санитарным требованиям и способы решения

Никак, с СанПиНами бороться невозможно, их надо соблюдать.

Искать другое здание или просить в аренду земельный участок и строиться самостоятельно.

А как вот это понимать?

Постановлением Главного государственного санитарного врача РФ от 9 сентября 2010 г. N 122 глава III настоящего приложения дополнена пунктом 3.17

3.17. При размещении объектов малого бизнеса, относящихся к V классу опасности, в условиях сложившейся градостроительной ситуации (при невозможности соблюдения размеров ориентировочной санитарно-защитной зоны) необходимо обоснование размещения таких объектов с ориентировочными расчетами ожидаемого загрязнения атмосферного воздуха и физического воздействия на атмосферный воздух (шум, вибрация, электромагнитные излучения). При подтверждении расчетами на границе жилой застройки соблюдения установленных гигиенических нормативов загрязняющих веществ в атмосферном воздухе и уровней физического воздействия на атмосферный воздух населенных мест, проект обоснования санитарно-защитной зоны не разрабатывается, натурные исследования и измерения атмосферного воздуха не проводятся.

Для действующих объектов малого бизнеса V класса опасности в качестве обоснования их размещения используются данные исследований атмосферного воздуха и измерений физических воздействий на атмосферный воздух, полученные в рамках проведения надзорных мероприятий.