Проблемы с фиктивными сделками с контрагентами - как решить ситуацию с требованиями налоговой

Несколько лет назад были подписаны договоры субподряда с контрагентами на производство определённых видов работ. Работы выполнены, полностью приняты, генеральному заказчику, претензий нет. По истечении нескольких лет при проверке документации ифнс, последняя делает вывод о фиктивности сделок с контрагентами, директора организаций ничего о зарегистрированных на их имена юр.лиц не знают и к их деятельности отношения не имеют, однако каждый из них утверждает, что в действительности были лица, с которыми сейчас связь утеряна, по просьбе которых они открывали организации и подписывали различные доверенности, за что получили разовое вознаграждение, после чего о деятельности не были осведомлены. В настоящее время налоговая проведя почерковедческую экспертизу признала подписи в счетах-фактурах недействительными и в связи с чем требует большие суммы налоговых вычетов проведённых по счетам фактурам. А также утверждает о фиктивности сделок и проведённых работах указанными организациями, вменяя должную неосмотрительность генеральному директору подрядчика, который сих позиции обязан был лично проверить по всем инстанциям организацию с которой заключает договор. Рекомендации ФНС это предусматривают, однако каким либо законом это не предусмотренно. И опять же, руководитель подрядчика приезжал на участки работ, где работа шла, и нареканий не вызывала, в связи с чем небыло оснований для каких-либо проверок иного характера в отношении контрагентов. Подскажите пожалуйста, как быть в данной ситуации?