Проблема нежилых помещений в жилых домах - как признать их в собственность муниципалитета?

Если это встроенные помещения, то у них либо должен быть собственник (ст. 209 ГК РФ) либо это возможно, что общедомовое имущество, которое является общей собственностью всех собственников помещений (ст. 36 ЖК РФ). Если же собственником у них по прежнему является МО, то надо добиваться передачи имущества

Как администрация может признать эти нежилые помещения в собственность муниципального образования

---никак не признает.нужно искать собственников данных нежилых помещений. ст 209 ГК РФ.

Статья 209. Содержание права собственности

[Гражданский кодекс РФ] [Глава 13] [Статья 209]

1. Собственнику принадлежат права владения, пользования и распоряжения своим имуществом.

2. Собственник вправе по своему усмотрению совершать в отношении принадлежащего ему имущества любые действия, не противоречащие закону и иным правовым актам и не нарушающие права и охраняемые законом интересы других лиц, в том числе отчуждать свое имущество в собственность другим лицам, передавать им, оставаясь собственником, права владения, пользования и распоряжения имуществом, отдавать имущество в залог и обременять его другими способами, распоряжаться им иным образом.

3. Владение, пользование и распоряжение землей и другими природными ресурсами в той мере, в какой их оборот допускается законом (статья 129), осуществляются их собственником свободно, если это не наносит ущерба окружающей среде и не нарушает прав и законных интересов других лиц.

4. Собственник может передать свое имущество в доверительное управление другому лицу (доверительному управляющему). Передача имущества в доверительное управление не влечет перехода права собственности к доверительному управляющему, который обязан осуществлять управление имуществом в интересах собственника или указанного им третьего лица.