Если я напишу раппорт на увольнение говорят, что я должен буду выплатить деньги за обучение.

Иван, вас вводят в заблуждение. п.7 ст.35 ФЗ "О воинской обязанности и военной службе" определены условия возмещения денежных средств: 7. Граждане, отчисленные из военных образовательных учреждений профессионального образования или учебных военных центров при федеральных государственных образовательных учреждениях высшего профессионального образования за недисциплинированность, неуспеваемость или нежелание учиться либо отказавшиеся заключить контракты о прохождении военной службы, а также граждане, окончившие указанные образовательные учреждения и уволенные с военной службы ранее срока, установленного контрактом о прохождении военной службы, по основаниям, предусмотренным подпунктами "д", "е", "е.1" и "з" пункта 1, подпунктами "в" и "д" пункта 2 статьи 51 настоящего Федерального закона, возмещают средства федерального бюджета, затраченные на их военную или специальную подготовку. Указанные граждане не возмещают средства федерального бюджета, затраченные на обеспечение исполнения ими обязанностей военной службы в период обучения.

В вашем случае, вы должны быть назначены на офицерскую должность ст.11 п.9 ППВС(Указ президента № 1237 1999 г.) . Военнослужащие, окончившие военно-учебные заведения, адъюнктуру, военную докторантуру, назначаются на воинские должности, подлежащие замещению лицами с необходимым уровнем образования и предусмотренные соответствующим перечнем воинских должностей.

При невозможности назначения на указанные воинские должности такие военнослужащие могут быть назначены на иные воинские должности, но не ниже ранее занимаемых.

Так как у вас в/зв лейтенант и должность никак не сержантская, то не соглашаться на сержантскую должность которая для вас является низшей - это ваше право. Следовательно, вы подлежите в таком случае при невозможности вас назначить на должность увольнению по ОШМ и при этом никаких выплат за обучение с вас никто не вправе истребовать.

Рапорт на увольнение не пишите, а напишите рапорт такой: С назначением на низшую должность не согласен, прошу назначить на должность в соотв. со ст.11 п. 9 ППВС. В таком случае вас обязаны направить в распоряжение на 6 мес. а затем уволить по ОШМ. Могут уволить и раньше, но тоже по ОШМ и больше ни по какой другой статье. Успехов!!!