Проблема с условным осуждением - право на подачу ходатайства самостоятельно, но суд рекомендует обратиться в уголовную инспекцию. Что делать?

Не на УДО. В названном Вами акте КС РФ говорится: "положения части первой статьи 74 УК Российской Федерации и части первой статьи 399 УПК Российской Федерации в их конституционно-правовом истолковании, вытекающем из сохраняющего свою силу Постановления Конституционного Суда Российской Федерации от 26 ноября 2002 года, не препятствуют условно осужденному обращаться в суд с ходатайством об отмене условного осуждения и снятии судимости и предполагают обязанность суда рассмотреть это ходатайство по существу, независимо от наличия представления органа, осуществляющего контроль за поведением условно осужденного, по данному вопросу". Отмена условного осуждения со снятием судимости и условно-досрочное освобождение от наказания - это разные вещи. Составляйте нормальное ходатайство об отмене условного осуждения и снятии судимости, прилагайте доказательства того, что Вы своим поведением доказали свое исправление, возместили вред (полностью или частично), причиненный преступлением, в размере, определенном решением суда, иные существенные обстоятельства. Ваше ходатайство обязаны рассмотреть в установленном порядке с вынесением соответствующего постановления, которое может быть Вами обжаловано в вышестоящие судебные инстанции с соблюдением установленного процессуальным законом порядка. Удачи.