Как решить ситуацию с разногласиями в зарегистрированных правах на участок после нового межевания?

В 2001 году получил земельный участок под строительство жилого дома и зарегистрировал право собственности, а когда начал строиться уточнили границы и постановление утвердили результат межевания, и выяснилось что участок по площади больше чем зарегистрированное право, решением постановлением администрации вся площадь передали в собственность и я обратился за регистрацией, однако мне отказали в регистрации в связи с наличием разногласии в зарегистрированных правах. Участок один и тот же на кадастровый учет поставили в результате нового межевания. Что мне делать?