Военнослужащий хочет обратить контракт на год, несмотря на предыдущий рапорт на 3 года

Вы уже написали заявление на заключение контракта на три года, поэтому ваши подписи в контракте, это просто формальность. То что вы писали новый рапорт на год, у вас нет никаких доказательств, не думаю что вы отдавали его в отдел кадров под роспись

Указ Президента РФ от 16 сентября 1999 г. N 1237 "Вопросы прохождения военной службы" (с изменениями и дополнениями)

II. Порядок заключения контракта и прекращения его действия

Статья 4. Заключение контракта и прекращение его действия

8. Контракт вступает в силу со дня его подписания должностным лицом, определенным настоящим Положением, о чем издается соответствующий приказ.

Срок контракта исчисляется со дня (календарной даты) вступления его в силу.

Статья 3. Начало, срок и окончание военной службы

4. Днем окончания военной службы считается день исключения военнослужащего из списков личного состава воинской части (здесь и далее под воинскими частями понимаются органы военного управления, органы, воинские части, корабли, соединения, предприятия, учреждения и организации Вооруженных Сил Российской Федерации (других войск, воинских формирований или органов), воинские подразделения федеральной противопожарной службы, органы военной прокуратуры, военные следственные органы Следственного комитета Российской Федерации, а также военные факультеты (кафедры) при образовательных организациях высшего образования) в связи с увольнением с военной службы, гибелью (смертью), признанием безвестно отсутствующим или объявлением умершим.

День исключения из списков личного состава воинской части является для военнослужащего днем окончания (последним днем) военной службы. Т.е. не день окончания контракта.