Какой порядок перевода?

1. Изучаете Правила землепользования и застройки городского округа - муниципального образования "город Екатеринбург";

2. Определяете возможные виды разрешенного использования вашего объекта капитального строительства (основные и условно разрешенные);

3. Если вид разрешенного использования "склады" является основным для вашего объекта капитального строительства, то будет достаточно обратиться с соответствующим заявлением в Росреестр (можно через МФЦ);

4. Если вид разрешенного использования "склады" является условно разрешенным для вашего объекта капитального строительства, то нужно обращаться уже в Администрацию города Екатеринбурга (более подробно в статье 39 Градостроительного кодекса Российской Федерации).

P.S. При возникновении проблем с первым и вторым пунктами пишите в Департамент архитектуры, градостроительства и регулирования земельных отношений Администрации города Екатеринбурга с просьбой разъяснить возникшие вопросы.