Как защититься от непоняток с изменением реквизитов при ДДУ?

Платите по старым счетам. Это их проблемы. Об изменении реквизитов вас должны были уведомить письменно заказным письмом - это если по закону.

Если по человечески и во избежание дальнейших споров и конфликтов лучше добиться, что бы вам дали новые реквизиты для оплаты-но только за их подписью, что они изменились со старых на новые.

Исходя из практики договорных отношений, то в первую очередь будет иметь значение то, что прямо указано в договоре. И если в договоре прямо указано, что Застройщик обязан уведомить о изменение реквизитов, то пока он Вас письменно не уведомил, то платить на другой счёт не надо. Если бы там была ссылка, что так же возможно информировать другим общественно доступным способом, то тогда можно было бы принимать информацию указанную на сайте, а по другому никак.

С учётом того, что у банка отозвали лицензию (общеизвестная информация и доказыванию не подлежит) и отделения банка закрыты вы никак не можете внести денежные средства на счёт «Застройщика». Уведомив застройщика о том, что вы сами заинтересованы узнать новые реквизиты чтобы платить, вы на 100% сняли с себя вину в случае если застройщик попытается взыскать с вас пени и суд на 100% откажет застройщику в его требованиях. Так что в этом плане вы ничего не нарушаете и поступили правильно.

По поводу того, должна ли стоять печать застройщика, на доп. соглашение, то с учётом того, что на оклейке прямо указано, что данный документ прошит, пронумерован, и скреплен печатью (если бы этой фразы не было, то тогда ни каких вопросов), а самого оттиска печати не имеется, то в случае судебных разбирательств могут быть проблемы «Застройщик» может ссылаться на недействительность документа, но шансы что суд будет на стороне застройщика ничтожны. В данном вопросе важнейшим значением будет иметь, тот факт, что данный договор зарегистрирован в Россреестре. А значит его официально государство приняло в учёт. Поэтом просто направьте в адрес застройщика Письмо с требованием разъяснить, по какой причине они не поставили оттиск печати при прошивке документа, может ответа и не будет, но главное сохранить копию письма подтверждающий факт направления.

Либо оплачивайте на старые реквизиты-тогда застройщик сам несет риск не получения денег. Либо оплачивайте на депозит нотариуса.

ГК РФ Статья 327. Исполнение обязательства внесением долга в депозит

1. Должник вправе внести причитающиеся с него деньги или ценные бумаги в депозит нотариуса, а в случаях, установленных законом, в депозит суда - если обязательство не может быть исполнено должником вследствие:

4) уклонения кредитора от принятия исполнения или иной просрочки с его стороны.

2. Внесение денежной суммы или ценных бумаг в депозит нотариуса или суда считается исполнением обязательства.

Нотариус или суд, в депозит которого внесены деньги или ценные бумаги, извещает об этом кредитора.

3. Во всякое время до получения кредитором денег или ценных бумаг из депозита нотариуса либо суда должник вправе потребовать возврата ему таких денег или ценных бумаг, а также дохода по ним. В случае возврата должнику исполненного по обязательству должник не считается исполнившим обязательство.