Скажите пожалуйста, если есть долги по коммунальным платежам, можно ли погасить основной долг без пени?

Просто так Вам никто этого сделать не даст.. платите по квитанции укажите, что оплатили основной долг.. Пени оспаривайте через суд.. если же оплату основного долга, засчитают в счет погашения платежей, тогда также оспаривайте через суд.. склоняя свои доводы к проблеме искусственного увеличения задолженности.

Здравствуйте, уплата пени предусмотрено п 14. ст.155 "Жилищного кодекса Российской Федерации" от 29.12.2004 N 188-ФЗ (ред. от 03.08.2018) Лица, несвоевременно и (или) не полностью внесшие плату за жилое помещение и коммунальные услуги, обязаны уплатить кредитору пени в размере одной трехсотой ставки рефинансирования Центрального банка Российской Федерации, действующей на день фактической оплаты, от не выплаченной в срок суммы за каждый день просрочки начиная с тридцать первого дня, следующего за днем наступления установленного срока оплаты, по день фактической оплаты, произведенной в течение девяноста календарных дней со дня наступления установленного срока оплаты, либо до истечения девяноста календарных дней после дня наступления установленного срока оплаты, если в девяностодневный срок оплата не произведена. Начиная с девяносто первого дня, следующего за днем наступления установленного срока оплаты, по день фактической оплаты пени уплачиваются в размере одной стотридцатой ставки рефинансирования Центрального банка Российской Федерации, действующей на день фактической оплаты, от не выплаченной в срок суммы за каждый день просрочки. Увеличение установленных настоящей частью размеров пеней не допускается.

Поэтому пени платить все равно придется.